Това е състояние, при което клетки, подобни на ендометриума (лигавицата на матката) се разпространяват извън матката, причинявайки хронично възпаление и сраствания. По неизяснени причини тези ендометриални клетки мигрират на други места в тялото, оформяйки ендометриозни лезии, които кървят с синхрон с хормоналните промени в тялото. Подобни огнища могат да се открият не само по репродуктивните органи, но и в областта на дебело черво, пикочен мехур, тазовата стена, в редки случаи и извън тазовата кухина, дори в белите дробове.